采用基因芯片筛选肝癌转移相关基因的研究

第二军医大学东方肝胆外科医院综合治疗一科

王 葵 沈 锋 施乐华阎振林卫立信丛文铭 孟超

    摘要 目的：用人基因表达谱 cDNA 芯片研究原发性肝癌(HCC)与癌旁正常肝组织的基因表达差异并进行验证。方法：利用含有人 5075 个基因 cDNA 的人表达谱芯片，将 6 例原发性肝癌患者分为伴和不伴门静脉癌栓两组(A 组和 B 组，每组 n=3)，分别取癌组织、癌栓组织和癌旁正常肝组织，分别抽提总 mRNA,反转录为 cDNA 与芯片进行杂交，对比 mRNA 表达的差异。在差异表达的基因中，选取 9 个基因在 41 例肝癌病人癌和癌旁正常肝组织进行 RT-PCR 实验验证其表达情况。 结果：癌组织及癌栓组织与癌旁正常肝组织比较，伴门脉癌栓组(A 组)癌组织与不伴门脉癌栓组(B 组)癌组织中上调表达基因分别有 169 和 170 个，两组下调表达基因分别有349 和 364 个，其中两组共同上调表达基因中 135 个，共同下调表达基因 305 个。两组癌组织分别表达上调和下调的基因之中，表达明显上调的基因(ratio>3)无癌栓组有 3 个、癌栓组有 5 个，而明显下调的(ratio<0.4)无癌栓组有 4 个、癌栓组有 10 个。分别挑选两组癌组织共同高表达基因(ASPH)、共同低表达基因(MT1X)、有癌栓组高表达基因(FACL4、POSTN、MAP4K4 、HSF1、UCHL1、DAP3、IARS)共 9 个，在 41 例 HCC 病人组织和四种肝癌细胞系中进行 RT-PCR 检测，其中 ASPH、MT-1X、MAP4K4 、FACL4、DAP3、HSF1 在癌组织中的表达与癌旁组织比较有显著差异或有差异(P＜0.01 或 P＜0.05)。结论：基因表达谱 cDNA 芯片是检测肝癌差异基因表达的有效方法，其基因变化可以进一步在 RT-PCR 中证实。ASPH、MAP4K4 、FACL4、DAP3、HSF1 和 MT-1X 在癌组织中表达明显高于和低于癌旁组织，在肝癌细胞系中表达亦增高和降低，但在 41 例标本中表达变化与伴或不伴门静脉癌栓相关性不明显。

    关键词 cDNA 芯片；肝细胞肝癌；门静脉癌栓；基因表达谱